Пуэрто Мальдонадо - город на юго-востоке Перу в джунглях Амазонки, расположенный в 55 километрах от границы с Боливией в месте слияния рек Tambopata и Madre de Dios River. Это столица региона Madre de Dios.
В 1901 перуанское правительство создало комитет пр исследованию национального дождевого леса. Во главе экспедиции, отправившейся в путешествие по реке Тамбопата, был Дон Хуан Вилалта, который и основал города 10 июля 1902 г как станцию, где сливаются две реки. Он назвал порт Faustino Maldonado в честь Тарапото, который исследовал реку Madre de Dios в 1861 и погиб, сплавляясь по порогам реки Маморе.
В 1912 году Пуэрто Мальдонадо стал столицей региона Madre de Dios.
По реке курсирует паром, который соединяет город с Куско. Попытка построить транс-атлантическую трассу не увенчалась успехом из-за нехватки средств.
Пуэрто Мальдонадо находится в бассейне реки Амазонки. Климат здесь влажный и жаркий, со среднегодовой температурой 26 С, сентябрь и август - самые жаркие месяцы. Ежегодное количество осадков превышает 1,000 мм. Сезон дождей длится с октября по апрель. Основная часть города расположена на небольшой возвышенности, и не затапливается. В сезон дождей часто бывает затруднено сообщение и передвижение.
Здесь также наблюдается феномен, который местные называют "surazo" или "friaje", когда полярные ветры начинают дуть с гор на юге. Тогда на несколько дней температура падает до 8 С.
Поблизости расположены Национальный Парк Manu, Национый заповедник Tambopata и Национальный Парк Bahuaja-Sonene. Это самые древние дождевые леса с излучинам рек и озерами, где гнездится множество разновидностей птиц, включая макао.